La Incubadora forma parte de la Red Nacional de Incubadoras (INCUBAR) del Ministerio de Economía, Planeamiento y Gestión para el Desarrollo Productivo y de la Bioeconomía y al mismo tiempo de la Red de Plataformas de Innovación de la Provincia de Santa Fe, dependiente de la Secretaría de Ciencia, Tecnología e Innovación y Secretaría de Transporte. Ministerio de Producción, Ciencia y Tecnología.

Localmente, es parte de la Red de Ciencia, Tecnología e Innovación (Red CTeI) de Rafaela, en la que confluyen varias instituciones (INTI, CONICET), Universidades y sus diferentes Centros de investigación (INLAIN - UNL, UCSE, PRAXIS – UNRaf, UTN sede Rafaela, Club de emprendedores UNRaf), Agencias de desarrollo (ACDICAR), que permite trabajar con una visión integral del ecosistema emprendedor de la región. A la vez, proyecta la salida de los emprendimientos acompañando el vínculo con la Aceleradora Litoral, con quien tiene firmado un Convenio de colaboración.

Cabe destacar que IncuVA tiene un socio estratégico fundamental, el INTI Departamento de Valorización de Subproductos del INTI, que presta servicios técnicos a las pymes, start up y empresas incubadas .
IncuVA tiene acuerdos de cooperación con otros entes del ecosistema emprendedor como Cites Impulsa, Gestinnova, Fundación Credicoop, Universidad Austral, etc.