El objetivo de las barreras zoosanitarias es minimizar el riesgo de ingreso a la región protegida de enfermedades y/o plagas perjudiciales para la producción agropecuaria, aplicando las medidas y acciones sanitarias necesarias para establecer, proteger y mantener el área libre de plagas con reconocimiento internacional, contribuyendo además con la fiscalización de calidad y sanidad agroalimentaria.

El Senasa desarrolla estrategias de control en cada región, mediante la instalación de controles dinámicos en carreteras críticas, controles fijos en barreras sanitarias y busca la ampliación de las estructuras participativas de control celebrando acuerdos o convenios con autoridades policiales nacionales, provinciales, para detectar movimientos ilegítimos o informales que pongan en peligro la salud pública.