En el interior del área protegida se reconoce una gran variedad y riqueza del patrimonio cultural. En este sentido, a partir del desarrollo de investigaciones arqueológicas y trabajos de técnicos de la APN se han podido identificar concentraciones superficiales de materiales líticos, estructuras de rocas basálticas de diversa morfología así como bardas con grabados rupestres, con una distribución heterogénea. Pueden encontrarse en lugares de reparo, estar asociado -o no- a arroyos o lagunas de carácter temporal, o bien en sectores de “pampas”.

A partir de la información disponible, se observa que en la Meseta del Lago Buenos Aires las ocupaciones de grupos cazadores-recolectores están asociadas al Holoceno tardío; es decir, tendrían una profundidad temporal que podría alcanzarse hasta los 3.500 años antes del presente.

Los establecimientos ganaderos y/o sus puestos también forman parte del patrimonio cultural del parque, cuya instalación en el noroeste de la provincia de Santa Cruz se produjo a lo largo del siglo XX. Si bien los cascos de las antiguas estancias se encuentran al pie de la misma meseta o en sus estribaciones, algunos puestos se encuentran sobre la misma meseta del Lago Buenos Aires y constituían puestos de veranada (espacios donde la hacienda pastaba en temporada estival).