Dentro del Estado Nacional confluyen las competencias de los órganos con diferentes niveles de responsabilidad y que integraron el Consejo de Administración del Área Marina Protegida Namuncurá Banco Burdwood I.

La Jefatura de Gabinete de Ministros, quien fuera autoridad de aplicación del AMP hasta el 8 de junio de 2017, lideró la coordinación interministerial con el Ministerio de Agroindustria, la Administración de Parques Nacionales (APN), el Ministerio de Seguridad, el Ministerio de Defensa, el Ministerio de Relaciones Exteriores y Culto, el Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación Productiva y el Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Además, la Provincia de Tierra del Fuego, Antártida e Islas del Atlántico Sur fue invitada a integrar el Consejo de Administración.

Esta confluencia de competencias y de órganos responsables hizo necesaria una coordinación efectiva para evitar superposiciones y vacíos en el accionar para el cumplimiento de los objetivos de la ley. Además, otros organismos del Estado Nacional confluyen con sus actividades en el cumplimiento de los objetivos establecidos para el Área Marina Protegida en particular. Entre ellos, el Servicio Meteorológico Nacional, el Servicio de Hidrografía Naval Instituto Geográfico Nacional, el Instituto de Investigaciones Científicas y Técnicas para la Defensa, el Instituto Nacional de Investigación y Desarrollo Pesquero, la Armada Argentina, la Prefectura Naval Argentina, la Comisión Nacional de Actividades Aeroespaciales, la Secretaría de Asuntos Relativos a las Islas Malvinas, Georgias del Sur, Sándwich del Sur y los Espacios Marítimos Circundantes, y la Dirección Nacional del Antártico.