El objetivo principal del PEI es instalar y desarrollar procesos de evaluación y mejoramiento de la función CyT.

Pueden participar las instituciones de CyT que constituyen el Consejo Interinstitucional de Ciencia y Tecnología (CICYT) y los organismos públicos provinciales de CyT. En el caso de los Organismos de Ciencia y Tecnología (OCT), la evaluación abarca a la institución en su conjunto y en el caso de las universidades, se trabaja en la evaluación y mejoramiento de la función CyT.

Este ciclo de actividades implica la realización de las autoevaluaciones, de las evaluaciones externas y la elaboración y ejecución de los planes de mejoramiento que se deriven de las evaluaciones a través del apoyo financiero del MINCyT.

Los proyectos pueden presentarse en cualquier momento a lo largo del año, ya que se trata de una convocatoria de ventanilla permanente.