El Departamento Parasitología organiza y dicta con periodicidad los siguientes cursos y jornadas:

• Curso de Metodología en el Diagnóstico de Enteroparásitos
• Taller de Certificación en el Diagnóstico Microscópico de Paludismo
• Jornadas de Toxoplasmosis
• Curso de Validación y Verificación de Métodos de Biología Molecular para Diagnóstico

Además, brinda permanencias programadas de diferente duración para profesionales y técnicos/as de diversas instituciones de salud que lo soliciten.

Entre las actividades de capacitación también se incluyen la rotación de residentes en Microbiología Clínica y el dictado del Módulo Parasitología de la Maestría en Microbiología Molecular, coordinada por la ANLIS y la Universidad Nacional de San Martín.